まあ，どんなフォントで埋め込もうが，
埋め込んでなかろうが，
PDFで送りつければいいように思いますよ
実際は内容の問題でしょう．
いらんこと考えて時間をつぶすよりも
論文の内容に注力するほうが
よっぽど建設的だと思います．
もし，PDFの内容が規定にあってないとかいう
表面的な理由でリジェクトするようなら
それはそれまでのような気がします
けど・・・経験上ですけどね．
投稿規程の中のデータフォーマット規定を
無視してても受理されてる論文はあります．
TeXとWordのみっていうのに
MacのiWorksできたり，
ScinetificWorkPlaceできたりもします．
そして印刷屋がひーひーいうわけです(^-^;