昨日の匿名です．前田さん，追試とご説明をありがとうございます．
> そもそも pLaTeX の jarticle.cls を用いた文書を pdflatex でコンパイルすると \NeedsTeXFormat{pLaTeX2e} で止まるはず
確かにその通りです．
> W32TeX の pdflatex でコンパイルするときに jTeX がインストールされていると，jlatex 用の jarticle.cls が読み込まれて上記のエラーが発生する
私が試したのも W32TeX なのですが，そうしますと，質問をされた方のお手元の TeX も W32TeX なのでしょうか? それならば，ダウンロードなどせずともはじめから TeXworks は使えるようになっているはずですが．