> >種々の混乱の元凶となりかねないので絶対にやめてください。
> 申し訳ありませんでした．
> 今後，このようなことのないようにいたします．
ここでそんなに謝らなければいけないようなことでもないですよ。
元ファイルを書き換えると何がいけないのかについては、
TeX Wikiの「パッケージファイルを直接書き換える方法」というところに書かれていますので、ご参考まで。
https://texwiki.texjp.org/?%E3%83%91%E3%83%83%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B8#tee3be98