macOS sierra(10.12) で a0202fd まで取り込みましたが問題ないです。
$HOME/Library/Caches/Homebrew/emacs--git で git log しても該当しそうなものは見受けられませんね。
ところで、投稿に反応していながらですが、brew に限らず git を利用して --HEAD で最新を参照するてのは安定版でないことを承知の上で使うのが前提ですよね。ですのでこんなこともあるんだ ... てことなんですよね。
ですのでここからは雑談。 brew reinstall で強制的に結果として最新が pull されるように見えます。