一般フォーラム

佐藤様

ヒントありがとうございます。
早速ご指摘の点をjarticle.clsと比較して、jsarticle/clsで
1374行で{2}を{3}にするとjarticle.clsと同じようになる。
すなわち

\setcounter{tocdepth}{2} -> \setcounter{tocdepth}{3}

のようにすると、うまくでました。他への副作用はわかりませんが。