pxchfon パッケージの最新版で、「中国語・韓国語フォントのサポート」および「明示的な非埋込の指定（\set～font の引数を * にする）」に対応しました。これを利用すると、次のように文書中でフォントの非埋込（および特定のフォントの埋込）の設定ができます。
% 文字コードはUTF-8
\documentclass[a4paper]{jsarticle}
% パッケージがいっぱいです...
\usepackage[bxutf8]{inputenc} %+ UTF-8 直接入力
\usepackage{pxbase} %+ を扱うための設定
\usepackage[multi]{otf}
\usepackage[english]{babel}
\usepackage[main=korean]{pxbabel} % メインを韓国語にした
\usepackage[noalphabet]{pxchfon}% フォントマップを設定したい
\setkoreanminchofont{*}%韓国語・明朝はフォント非埋込にする
% あるいは自分の持っている特定のフォントを埋め込みたい場合は
%\setkoreanminchofont{UnBatang.ttf}%←ファイル名を指定
\begin{document}
漢字ひらがなカタカナ한글。
\end{document}