私も何の気なしにアップデートして何の気なしにuplatex→dvipdfmxのテストをしたら
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dvipdfmx:fatal: Unable to find TFM file "cidjmr3-v".
No output PDF file written.
というエラーに遭遇して面食らいました。expertオプションを使ってるファイルでした。またこのファイルでは\OTF, \UTFコマンドは全く使ってません。expertを外したら今度は
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dvipdfmx:fatal: Unable to find TFM file "cidjmr1-v".
No output PDF file written.
確かに前の版とみくらべるとゴッソリとcid*[1234] の類いがなくなってますね。