upLaTeX＋divpdfmx下でexpertオプション付きのotfパッケージを利用すると、異体字セレクタを与えた文字が出力されません。
\documentclass[uplatex, dvipdfmx]{jsarticle}
\usepackage[expert, jis2004]{otf}
\begin{document}
あ葛\symbol{"E0100}い葛う、
あ塚\symbol{"FE00}い塚う。
あ曙い曙\symbol{"E0101}う、
あ社い社\symbol{"FE00}う。
\end{document}
