１）TeXworks の upmendex を起草してタイプセットしようとする
設定画面のスクリーンショットを添付していただけませんか？
２）$basename
指定されたファイル名（例えば「test.tex」であれば）
拡張子「.tex」を取り除いた「test」です。
TeXworks のタイプセット方法は基本的には
「TeXworks/設定 (*1)」を参考にしてください。
(*1) https://texwiki.texjp.org/?TeXworks%2F%E8%A8%AD%E5%AE%9A
なお以前、話題にされた「mendexの-s オプションの使い方 特に2つある場合」
のスレッドで TeXworks の「タイプセット方法を設定する」の
添付画像(*2) は参考にならないでしょうか？
(*2) https://okumuralab.org/tex/mod/forum/discuss.php?d=3541&parent=21874
「TeXworks/設定 (*1)」を参考にしてください。
(*1) https://texwiki.texjp.org/?TeXworks%2F%E8%A8%AD%E5%AE%9A
なお以前、話題にされた「mendexの-s オプションの使い方 特に2つある場合」
のスレッドで TeXworks の「タイプセット方法を設定する」の
添付画像(*2) は参考にならないでしょうか？
(*2) https://okumuralab.org/tex/mod/forum/discuss.php?d=3541&parent=21874