和田勇さま
お返事ありがとうございます。
>解決されたとのことですが documentclass を変更されましたか？ あるいは latexmk のセットアップを施されませんでしたか？
documentclassは変化せずにうまくいきました。
latexmkrcの方法は存じ上げておりましたので、そのように設定しました。
ソースやファイルについては、承知いたしました。
不慣れで申し訳ございません。
ファイルは一つしか投稿できなかったのに気づきまして、アップロードを諦めてしまっていたのですが、zipという方法で今後試したいと思います。
改めて、ありがとうございました。