数式関係は不案内なのですが、検索したら以下の記事がヒットし、奥村先生のコメントを参考にさせていただきました。
単にalign環境の中にあってはならない段落の区切り（空行）が入っているだけでしょう。
\begin{align}
s_1&= a_1 \\
s_2&=a_1+a_2
\end{align}
のようにお使いください。
数式関係は不案内なのですが、検索したら以下の記事がヒットし、奥村先生のコメントを参考にさせていただきました。
単にalign環境の中にあってはならない段落の区切り（空行）が入っているだけでしょう。
\begin{align}
s_1&= a_1 \\
s_2&=a_1+a_2
\end{align}
のようにお使いください。