\documentclass[dvipdfmx]{jsarticle}
\newcommand{\bm}[1]{{\mbox{\boldmath $#1$}}}
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\def\qed{\hfill $\Box$}
\newcommand{\ctext}[1]{\raise0.2ex\hbox{\textcircled{\scriptsize{#1}}}}
\newfont{\bg}{cmr9 scaled\magstep4}
\newcommand{\bigzerol}{\smash{\lower1.0ex\hbox{\bg 0}}}
\newcommand{\bigzerou}{%
\smash{\hbox{\bg 0}}}
\parindent = 0pt
\begin{document}
\begin{equation*}
\begin{matrix}
\xymatrix{
F(A)\ar[r]^{F(f)}\ar[d]_{\alpha_A}\ar@/_26pt/[dd]_{1_{F(A)}}&F(A')\ar[d]^{\alpha_{A'}}\ar@/^26pt/[dd]^{1_{F(A')}}\\
G(A)\ar[r]_{G(f)}\ar[d]_{\alpha^{-1}_A}&G(A')\ar[d]^{\alpha^{-1}_{A'}}\\
F(A)\ar[r]_{F(f)}&F(A')
}
&
\xymatrix{
G(A)\ar[r]^{G(f)}\ar[d]_{\alpha^{-1}_A}\ar@/_26pt/[dd]_{1_{G(A)}}&G(A')\ar[d]^{\alpha^{-1}_{A'}}\ar@/^27pt/[dd]^{1_{G(A')}}\\
F(A)\ar[r]_{F(f)}\ar[d]_{\alpha_A}&F(A')\ar[d]^{\alpha_{A'}}\\
G(A)\ar[r]_{G(f)}&G(A')
}
&
\NewAdigraph{AdigraphB}{
G-A:0,0:G(A);
G-A':3,0:G(A');
F-A:0,3:F(A);
F-A':3,3:F(A');
}{
F-A,G-A:1:$\alpha_A$;
G-A,F-A:1:$\alpha^{-1}_A$;
F-A,F-A':1:$F(f)$;
G-A,G-A':1:$G(f)$;
F-A',G-A':1:$\alpha_{A'}$;
G-A',F-A':1:$\alpha^{-1}_{A'}$;
F-A,F-A:1:$1_{F(A)}$;
F-A',F-A':1:$1_{F(A')}$;
G-A,G-A:1:$1_{G(A)}$;
G-A',G-A':1:$1_{G(A')}$;
}\AdigraphB{}
\end{matrix}
\end{equation*}
\end{document}
と入力したところ和田さんの言う通りグラフは出力されたのですが
-
AdigraphB がページ溢れしてしまう
-
AdigraphBがxymatrixで描画したものと並ばない