目次を\tableofcontentsで作成した際，
第n章 ほげほげ
---改ページ---
m ほげほげほげ
のように，ある章の節が全部次のページに表示されてしまうことが気に入らず，tocファイルを弄って適当に\newpageしたところ，1回のコンパイルではうまくいきますが2回以上コンパイルすると（予想通り？）\newpageが消えてしまいます．
目次の改ページを弄り，かつそれをうまく保存するような方法はありますでしょうか？
toc ファイルをいじった後、ソースのプレアンブルに \nofiles を加えると、
それ以上以降は、タイプセット時にtoc ファイルが変化しなくなります。
しかし、今回の場合、目次中に手動で \newpage を入れたことによって、
目次内の表示ページ番号がずれてくることが考えられ、そのずれも
反映されなくなるのでまずいでしょう。
代わりに \addcontentesline を使うとよかろうと思います。
\documentclass{jsbook}\relax
\begin{document}
\tableofcontents
\chapter{first}
first chapter
\section{first}
firstsection
\addtocontents{toc}{\newpage}% <-- 目次中のこの位置で改ページ
\section{second}
second
\section{third}
third
\chapter{second}
second chapter
\section{first}
firstsection
\addtocontents{toc}{\newpage}% <-- 目次中のこの位置で改ページ
\section{thifd}
second
\section{third}
third
\chapter{third}
third chapter
\section{first}
firstsection
\addtocontents{toc}{\newpage}% <-- 目次中のこの位置で改ページ
\section{second}
second
\section{third}
third
\end{document}
それ以上以降は、タイプセット時にtoc ファイルが変化しなくなります。
しかし、今回の場合、目次中に手動で \newpage を入れたことによって、
目次内の表示ページ番号がずれてくることが考えられ、そのずれも
反映されなくなるのでまずいでしょう。
代わりに \addcontentesline を使うとよかろうと思います。
\documentclass{jsbook}\relax
\begin{document}
\tableofcontents
\chapter{first}
first chapter
\section{first}
firstsection
\addtocontents{toc}{\newpage}% <-- 目次中のこの位置で改ページ
\section{second}
second
\section{third}
third
\chapter{second}
second chapter
\section{first}
firstsection
\addtocontents{toc}{\newpage}% <-- 目次中のこの位置で改ページ
\section{thifd}
second
\section{third}
third
\chapter{third}
third chapter
\section{first}
firstsection
\addtocontents{toc}{\newpage}% <-- 目次中のこの位置で改ページ
\section{second}
second
\section{third}
third
\end{document}
既に綴じてしまった話題ではありますが…
目次中の Chapter の直前で改ページするよりも、各 Chapter の最初の section の
直前でのページ分割を抑制する方が良さそうに思います
※ 目次中の不都合なページ分割を目視で確認する手間が（相当程度）省けるでしょう。
\documentclass{jsbook}\relax
\begin{document}
\tableofcontents
\chapter{first}
first chapter
\addtocontents{toc}{\protect\nopagebreak[4]}% <-- 目次中でのページ分割を抑制
\section{first}
firstsection
\section{second}
second
\section{third}
third
\chapter{second}
second chapter
\addtocontents{toc}{\protect\nopagebreak[4]}% <-- 目次中でのページ分割を抑制
\section{first}
firstsection
\section{thifd}
second
\section{third}
third
\chapter{third}
third chapter
\addtocontents{toc}{\protect\nopagebreak[4]}% <-- 目次中でのページ分割を抑制
\section{first}
firstsection
\section{second}
second
\section{third}
third
\end{document}
もう見ておられないかな…？
目次中の Chapter の直前で改ページするよりも、各 Chapter の最初の section の
直前でのページ分割を抑制する方が良さそうに思います
※ 目次中の不都合なページ分割を目視で確認する手間が（相当程度）省けるでしょう。
\documentclass{jsbook}\relax
\begin{document}
\tableofcontents
\chapter{first}
first chapter
\addtocontents{toc}{\protect\nopagebreak[4]}% <-- 目次中でのページ分割を抑制
\section{first}
firstsection
\section{second}
second
\section{third}
third
\chapter{second}
second chapter
\addtocontents{toc}{\protect\nopagebreak[4]}% <-- 目次中でのページ分割を抑制
\section{first}
firstsection
\section{thifd}
second
\section{third}
third
\chapter{third}
third chapter
\addtocontents{toc}{\protect\nopagebreak[4]}% <-- 目次中でのページ分割を抑制
\section{first}
firstsection
\section{second}
second
\section{third}
third
\end{document}
もう見ておられないかな…？