一般フォーラム

\documentclass{article}
\begin{document}

\newcounter{counterA}
\newcounter{counterB}

\def\macroA#1{%
   \setcounter{counterB}{0}%
   \loop\ifnum #1>\value{counterB}%
      \stepcounter{counterB}%
      [\thecounterB]
   \repeat}

\setcounter{counterA}{0}
\loop\ifnum 3>\value{counterA}%
   \stepcounter{counterA}%
   (\macroA{\value{counterA}})
\repeat
%%% ↑これはうまくいかない（今回の件は本質的にはこれと同じ（\scsnowman の
%%%   内部処理に \loop ... \repeat を使うマクロが含まれている））．
%%% \macroA の処理の中の \loop ... \repeat が，
%%% 外側の \loop ... \repeat の際に内部的に定義された \iterate を
%%% 変更してしまう．

\setcounter{counterA}{0}
\loop\ifnum 3>\value{counterA}%
   \begingroup%%% グルーピングで，内側の \loop ... \repeat が
              %%% 外側に影響しないようにすれば予定どおりに動く
   \stepcounter{counterA}%
   (\macroA{\value{counterA}})
   \endgroup
\repeat

%%% もっとも，最初から LaTeX の制御構造を使えば問題ない
\makeatletter
\def\macroA#1{%
   \setcounter{counterB}{0}%
   \@whilenum #1>\value{counterB}\do{%
      \stepcounter{counterB}%
      [\thecounterB] }}
\setcounter{counterA}{0}
\@whilenum 3>\value{counterA}\do{%
   \stepcounter{counterA}%
   (\macroA{\value{counterA}}) }
\makeatother
\end{document}