lualatex でコンパイルすると疑問符の後ろに
不自然な空白が挿入されるように見えます。
全角の感嘆符でも同様なようです。
試しに少し変更して platex/uplatex + dvipdfmx だと自然に見えます。
\documentclass[12pt]{ltjarticle}
\usepackage{luatexja-fontspec}
\setmainjfont[BoldFont=IPAexGothic]{IPAexMincho}
\setsansjfont{IPAexGothic}
\begin{document}
(?)
\end{document}
環境は Debian/stretch で
This is LuaTeX, Version 0.95.0 (TeX Live 2016/Debian)
なバージョンですが TeXLive2017
This is LuaTeX, Version 1.0.4 (TeX Live 2017)
でも同じようです。よろしくお願いします。