Tikzpeopleが何か設定をいじっているのでしょうか？
対処法をご教授いただければ助かります。
以下のソースで正しく表示されない現象を確認しました。
\documentclass[12pt,dvipdfmx,uplatex]{jsarticle}
\usepackage{tikz}
\usetikzlibrary{positioning,intersections}
\usetikzlibrary{patterns}
\usepackage{tikzpeople}
\begin{document}
\begin{tikzpicture}
\draw [latex-latex,thick] (0,6) node (yaxis) [above] {$r,c$} |- (10,0) node (xaxis) [right] {$t$};
\draw [name path=L1] (0,3) -- (9,3) node[right]{$c_E$};
\node (c) at (0,3) [left] {$b$};
\node (d) at (0,5) [left] {$a$};
\draw [name path=L2] (0,3) -- (9,1.5) node[right]{$r_1$};
\draw [name path=L3] (0,5) -- (8,0) node[below right]{$r_2$};
\path[name intersections={of=L1 and L3}];
\coordinate (a) at (intersection-1);
\path[name intersections={of=L2 and L3}];
\coordinate (b) at (intersection-1);
\draw[thick, dotted ] (a) -- (a |- xaxis) node[below] {$t^{1}$} ;
\draw[thick,dotted ] (b) -- (b |- xaxis) node[below] {$t^{2}$} ;
\fill[pattern color=orange, pattern=north east lines] (0,3) -- (0,5) -- (a) -- cycle;
\fill[pattern=north east lines,pattern color=blue] (b) -- (8,0) -- (9,1.5) -- cycle;
\end{tikzpicture}
\end{document}
MacTex 2017 のupLaTeXやLuaLaTeXでこの現象が起こります。
パッケージはすべて最新のものにアップデートしています(2017年6月19日現在)。