とても明確なアドバイスをありがとうございました．
これを解決するには，たとえば，次の二つの方法がありますね．
1. wave.eps の宣言 %%BoundingBox: 50 50 301 226 を修正する．
2. \includegraphics[width=10cm, bb=50 50 301 250, clip]{wave.eps} として，bbを再設定する．
wgnuplot の仕様を調査していませんが，そもそも wave.eps の宣言に不都合があるので 1. の方法が順当でしょうか．
これですっきりしました．感謝申し上げます．