一般フォーラム

LaTeX 2015/01/01 で入った互換性のない変更の中のどれかが壊してしまったようです。

\RequirePackage[2014/12/31]{platexrelease}
\documentclass{jsarticle}
\usepackage{blkarray}
\begin{document}
%\BAtablenotesfalse % footnoteを脚注部に表示する
\BAtablenotestrue % footnoteを表直下に表示する
\begin{blockarray}{lrr}
\hline
品名 & 単価(円) & 個数 \\ \hline
りんご\footnote{青森産} & 100 & 5 \\
みかん\footnote{愛媛産} & 50 & 10 \\ \hline
\end{blockarray}
\end{document}

だとエラーになりませんが

\RequirePackage[2015/01/01]{platexrelease}
\documentclass{jsarticle}
\usepackage{blkarray}
\begin{document}
%\BAtablenotesfalse % footnoteを脚注部に表示する
\BAtablenotestrue % footnoteを表直下に表示する
\begin{blockarray}{lrr}
\hline
品名 & 単価(円) & 個数 \\ \hline
りんご\footnote{青森産} & 100 & 5 \\
みかん\footnote{愛媛産} & 50 & 10 \\ \hline
\end{blockarray}
\end{document}

だとおっしゃるとおりエラーになります。

! TeX capacity exceeded, sorry [input stack size=5000].
\font@name ->
            \JY1/mc/m/n/5
l.12 \end{blockarray}

----------

pLaTeX や jsclasses は脚注関係のマクロを再定義していますが、それとは無関係なようです。実際

%\RequirePackage[2014/12/31]{latexrelease}
\documentclass{article}
\usepackage{blkarray}
\begin{document}
\LaTeXe\ \fmtversion
\begin{blockarray}{lrr}
\hline
Aaa & Bbb & Ccc \\ \hline
Ddd\footnote{footnote-d} & Eee & Fff \\
Ggg\footnote{footnote-g} & Hhh & Iii \\ \hline
\end{blockarray}
\end{document}

を pdflatex で処理してもエラーです。

! TeX capacity exceeded, sorry [input stack size=5000].
\font@name ->
            \OMX/cmex/m/n/5
l.11 \end{blockarray}

どの変更が critical なのかまでは突き止めていません。