Macを使用しています。
XyMTeXを使用して化学構造式を描画しようとすると、価標だけが描画されません。(下図の状態)
サンプルソースとして後述のPDFから 3.3 節のコードを引用し、
xymtextest.tex というファイルを作成して、ターミナルからコンパイルしてみました。
%---(以下 xymtextest.tex の中身)---
\documentclass{jarticle}
\usepackage{xymtex}
\usepackage{xymtexps}
\usepackage{xymtexpdf}
\begin{document}
\decaheterov[d{a\fivefusev[%
{b\sixfusev[f]{2s==\fiveheterov[%
{b\sixfusev{1==\upnobond{N}{H}}%
{3B==CH$_{3}$}{e}}%
]{1==O;5s==\WedgeAsSubst(0,0)(5,-3){130};%
2s==\WedgeAsSubst(0,0)(-5,-3){120}%
}{5==(yl);2GA==H;4GA==CH$_{3}$;3FB==H}[ae]%
}{1==\lmoiety{H$_{3}$C}}{e}}]%
{}{5FA==H;4D==O;2GA==H}{e}}%
]{}{{10}B==\lmoiety{H$_{3}$C};2FB==H;%
6B==\lyl(3==O){0==\sixsugarh{6==O;%
1s==\WedgeAsSubst(0,0)(-3,-5){120};%
4s==\WedgeAsSubst(0,0)(3,-5){120};
3s==\psline[linewidth=30\unitlength,%
linestyle=solid,linecolor=black]%
(-17,0)(307,0)%
}{1==(yl);2Sa==OH;3Sb==OH;4Sa==HO;%
5Sb==CH$_{2}$OH}[abc]}}
\end{document}
%---(以上)---
出力結果は、うまくいけば『化学構造式をXyMTeXで描く』の 3.3 にあるような構造式が描けるはずなのですが(下図)、
冒頭の図のように、ここから価標が落ちた状態のものしか描画できませんでした。
LaTeXiT を使って行っても、同じ結果になりました。
ちなみに、xymtex は、以下のディレクトリに置いてあります。
/usr/local/texlive/2015/texmf-dist/tex/latex/xymtex
試しに、/tex 内の同列にある /platex 内に置いても同じ結果になりました。
LaTeXのpicture環境との兼ね合いなどに原因があるのでしょうか?