LuaTex-ja 20160131.0 を出しました．
主な変更点としては，
* luatexja-preset.sty における nfssonly オプション
（luatexja-fontspec を読まずに和文フォントを設定する）で
scale=<float>, match オプションが使用可能に
* \verb, verbatim 環境下での和文フォントファミリを \jttdefault
で指定可能に（標準値は \mcdefault 明朝体）．
ltjsarticle などや luatexja-{fontspec,preset} で match オプションを
指定した場合は，
- \ttfamily によって和文フォントファミリが \jttdefault に
- \jttdefault の値が \gtdefault（ゴシック体）に
ですが，その他にも細かいバグ修正を行いました．
なお，いつからかは把握していないのですが，luatexja-otf.sty
による IVS 対応を有効化（\directlua{luatexja.otf.enable_ivs()}）
すると，縦組時にグリフが横組用字形のままになったり，
縦組時にその他 OpenType 機能が使えなくなるようです．
（少なくともこちらでは）LuaTeX ではなく LuaJITTeX を使うと
この症状は再現しないようですが，よくわかっていません．