一つをupdateすると大抵updateの嵐にはまるので，いけないなと思いながらも，なかなか踏ん切りがつかないのですが，やってみました．
xetex関連をupdateしても直りませんでした（当たり前ですかね）．この後，xecjk関連のエラーに対応するためいくつかupdateを行わないといけませんでしたが，最終的にpgf関連のパッケージをupdateするとfading出来ないという問題は見事に解決しました．
いつも有難うございます．
大変助かりました．