TeXShop の MacTeX 2013 対応日本語設定プロファイルは，Ver. 3.21のタイミングで本家開発元に取り込んでもらいました。
しかし，TeXShop 3 系列はLion以降でしか動きません。MacTeXおよび美文書第6版のインストーラは，10.6環境で起動された場合，開発停止状態にあるTeXShop 2 系列の最終版 2.47 をやむなくインストールするようになっています。しかし，もはや 2.47 は開発停止状態のため，新規に日本語設定プロファイルを導入することは困難な状況です。
TeXShop 3.x で修正された様々なバグも TeXShop 2.47 では放置されたままになっておりますので，MacTeXの推奨環境はあくまで10.7以降であるとご理解下さい。