匿名様、ご指摘ありがとうございます。
サンプルを定時せず、申し訳ありませんでした。
以下、作成しているtexファイルです。
\documentclass[openany]{tbook}
\usepackage{setspace}
\usepackage{graphicx}
\usepackage{okumacro}
\usepackage{draftwatermark}
\usepackage[bxutf8]{inputenc}
\usepackage{bxbase}
\usepackage{pxbase}
\usepackage[english]{babel}
\usepackage[main=japanese]{pxbabel}
\usepackage[deluxe]{otf}
\usepackage[usecmapforalphabet]{pxchfon}
…
\begin{document}
\chapter{あいうえお}
\begin{quote}
あああ．いいい，
\end{quote}
\end{document}
上記のように記述すると、
あああ。いいい。
と、PDFに出力されていましたが、
ご指摘頂いた通り、otfパッケージを利用しておりましたので、noreplaceオプションを用いていたところ、全角のピリオドとカンマが出力されました。
ご教授頂き、ありがとうございました。
しかし、別な問題が新たに発生してしまいました。
noreplaceを指定したことによって、ダブルクォートや引用符の体裁が変化してしまいました（当たり前の現象ですが…）。
noreplaceが反映されるのは、全角ピリオドとカンマだけで良いのですが、指定文字だけnoreplaceの状態にするというのは可能でしょうか？