MacTeX-2013のインストールについて

Re: MacTeX-2013のインストールについて

- 安田 亨 の投稿
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一冊の本を多くの人でタイプセットする。
最後にインプットファイルを作って合体する。
そのときに、Windows、Macの古いTeX,新しいTeXでタイプセットしたファイルが混在する可能性がある。この場合、UTF-8はやめておいた方がいいということでしょうか?
私は気楽に全角〜を使っている方ですが、化ける危険があるということですね?