\papersize{papersize=127mm,89mm}
の代わりに
\usepackage[papersize={127mm,89mm}]{geometry}
を書いて実行してみたところレターサイズで左上に127mmx89mmのグラフが表示される結果となりました.そこで,
\papersize{papersize=127mm,89mm}と\usepackage[papersize={127mm,89mm}]{geometry} 両方書いて見たところ127mmx89mmのPDFが出来上がりました.なぜ両方ないと悪いのかという 検証は,TeXの知識が足りないためできませんが... あと,文字化けの件もエンコーディングをUTF-8にすることで解決しました. 以下にソースを示させていただきます. \documentclass{article} \usepackage{pdfpages} \usepackage{xltxtra} \usepackage[atend]{bookmark} \pagestyle{empty} %\special{papersize=127mm,89mm} \usepackage[papersize={127mm,89mm}]{geometry} \begin{document} \bookmark[page=1,level=0]{ページ} \includepdf[pages=-]{1page.pdf} \end{document} なお,xelatexは3.1415926-2.2-0.9995.2 を使っています.