Unicode TeXではすべてのUnicode文字がそのまま（UTF-8で？）出力されるようですが、
レガシーなTeXは初期状態では制御文字や文字コード128以上の印刷不可能な文字は^^表記で出力されるようになっています。
ただしTeX Liveのlatex, pdflatexではフォーマット作成時に-translate-file=cp227.tcxが指定されていて0x09 (HT; 水平タブ), 0x0a (LF; 改行), 0x0b (VT; 垂直タブ)の3文字と128以上の文字はそのまま出力されるようです。
platex, uplatexでも実行時のコマンド引数に-translate-file=cp227.tcxを付ければlatex, pdflatexと同じ動作になります。