PDF ファイルが壊れている・うまく作成できなかった状態で 15 バイトしかかかれていませんね。
さて patch.app が終了すると「/tmp/bibunsho7-patch.log云々」のダイアログが表示された思うのですが、
まだ、残っていますか？存在すればそれを添付してください。
また、残っていなければ、command.tex のあるディレクトリに移動し
dvipdfmx -vv comannd.dvi
を実行したときに、表示される内容をコピペでファイルに書き、添付ファイルとしてアップしてください。
なお、当方では、提示された URL をたどり、
https://github.com/munepi/bibunsho7-patch/releases/download/v1.9/Bibunsho7-patch-1.9-20211113.dmg
を利用してパッチ適用後、英 横 さんの command.dvi から上記 dvipdfmx コマンドを使って
以下のように、埋め込みができたことは、確認しました。
pdffonts command.pdf
name type encoding emb sub uni object ID
------------------------------------ ----------------- ---------------- --- --- --- ---------
KIZTPN+HiraMinProN-W3-Identity-H CID Type 0C Identity-H yes yes no 4 0
ARJIBK+CMR10 Type 1C Builtin yes yes yes 6 0