~/Library/Preferences/TeXShop.plist
とか
~/Library/TeXShop
とか
~/Library/Cache/TeXShop
を削除してもだめでした，
uAppでTeX関連ファイルも完全に削除した後に，
再インストールしてもだめでした．
とりあえず，当分の間はmiで編集しようかと考えています．
下記Webページにて現在ダウンロードできる
Latest TeXShop for system 10.4 and 10.5
に何か仕様変更があって，バグが生じているという可能性は
考えられませんでしょうか？
また，OS X 10.5に対応した過去のバージョンをどこかで
公開していたりはしないのでしょうか．
http://www.uoregon.edu/~koch/texshop/obtaining.html