一般フォーラム

iwona.styで

\renewcommand{\bfdefault}{b}

となってるのが原因でしょうね

・\textbfは\bfseriesを呼び出す
・\bfseriesは書体を\bfdefaultに変える
・LaTeXのデフォルトの\bfdefaultはbx
・pLaTeXはbxをゴシックに割り当てる

ということで，iwonaを読むと

\textbf
-> b の書体が呼ばれる
-> JY2/mc/b/n が呼ばれる（ここが本来は JY2/mc/bx/n）
-> JY2/mc/b/nは未定義なのでJY2/mc/m/nが呼ばれる
-> 明朝になる

となるのでしょう．ということで
JY2/mc/b/nがJY2/mc/bx/nもしくはそれの本体の
JY2/gt/m/nになればいいので
以下のような感じでどうでしょう．

\documentclass[uplatex]{jsarticle}
\usepackage{iwona}
\DeclareFontShape{JY2}{mc}{b}{n}{<->ssub * gt/m/n}{}

\begin{document}
\textbackslash textbfしても \textbf{太字(bold)にならない}。
\end{document}

下記のように、とりあえず、iwonaパッケージを読み込んだ直後に
\renewcommand{\bfdefault}{bx}
を記述してください
（たぶん、普通に本文書体を OT1 で iwona regular を使うだけだったら、これでOKなはず；後述）。

\documentclass[uplatex]{jsarticle}
\usepackage{iwona}\renewcommand{\bfdefault}{bx}%%reset \bfdefault
\begin{document}
\textbackslash textbfしても \textbf{太字(bold)にならない}。
\end{document}

この現象がおこる理由は、iwonaパッケージが \bfdefault を b に上書きしちゃったことです。

（でも、OT1 や OML など fd には、bx の定義から ssub で b にしちゃっているから、
なんで iwona.sty でわざわざ \bfdefault を b にしちゃうのか、パッと見でその意図が不明です。
iwonaパッケージのドキュメントとかに何か書いてあるかもです（知りませんが…）。）

これ美文書p.229でも書いたのですが，iwonaでもそうでしたか。

逆に日本語をbでも太字にするというのでもよさそうですね。