本件は自己解決しました。
申し訳ありません。
2018/01/14付けのLuaLaTeX-ja用jsclasses互換クラス・マニュアルp.14を参照して、下記のようにしてみたら、期待通りになりました。
%#!lualatex
\documentclass[tombow,a4paper,nomag,9pt,a4paper,openright,twoside,tombow]{ltjsarticle}
\usepackage{bxjalipsum}
\usepackage{graphicx}
\usepackage{color}
\usepackage{xhfill}
\usepackage{xcolor}
\iftombow
\newlength{\stockwidth}
\newlength{\stockheight}
\setlength{\stockwidth}{\paperwidth}
\setlength{\stockheight}{\paperheight}
\advance \stockwidth 2in
\advance \stockheight 2in
\ifdefined\pdfpagewidth
\setlength{\pdfpagewidth}{\stockwidth}
\setlength{\pdfpageheight}{\stockheight}
\else
\setlength{\pagewidth}{\stockwidth}
\setlength{\pageheight}{\stockheight}
\fi
\else
\ifdefined\pdfpagewidth
\setlength{\pdfpagewidth}{\paperwidth}
\setlength{\pdfpageheight}{\paperheight}
\else
\setlength{\pagewidth}{\paperwidth}
\setlength{\pageheight}{\paperheight}
\fi
\fi
\begin{document}
\jalipsum{wagahai}
\end{document}
# geometry.styを使うと元の木阿弥状態ですが。