「
otfinfo -i /usr/local/texlive/texmf-local/fonts/opentype/HiraMinProN-W2.otf
」でフォント情報は表示され、「
kpsewhich HiraMinProN-W2.otf
」でパスの表示ができることを確認しました。(注意として書いていただいたことは承知しております。ありがとうございます。)
上記の状態でタイプセットした所、同じエラーが発生しました。
根本的な解決策とはなっていないかもしれませんが、
/usr/local/texlive/texmf-local/fonts/opentype/HiraMinProN-W2.otf
のエイリアスをtexファイルと同じディレクトリにコピーしたところ、
明朝のフォントがヒラギノ明朝ProN-W3からヒラギノ明朝ProN-W2に変更されました。