こちらで試したところ、どうも errorlevel が期待したように設定されないようです。
テスト用のバッチファイルと TeX ソースを添付します。
TeX ソース（unresolvable_ref.tex）は、何回コンパイルしても相互参照が
解決されないように記述しています。そしてバッチファイル（test.bat）は、
そのソースを LaTeXCompile でコンパイルし、errorlevel が 1 以上であれば
FAILUREと、そうでなければ SUCCESS と表示するようにしてあります。
手許の環境で test.bat を走らせると、最後に SUCCESS と表示されて
しまいます。
LaTeXCompile について、また要望というか、気がついたことがありますので、
ご注進です。
ver.0.15 から、未知のオプションは latex にそのまま渡すように
なったようですが、実際には、うまく渡されていないようです。
たとえば、
latexcompile -shell-escape FILENAME
とした場合、呼び出されるコマンドラインは、
platex FILENAME -shell-escape
となっています。platex は、ファイル名引数より後の引数は
無視しますので、結果として
platex FILENAME
と同じことになってしまっています。