昨日，ZRさんに教えてもらってpgfをupdateしてfadingの問題は解決したのですが，今度はBeamerのenumerateでballの中の数字の色が白ではなく黒になるという問題に遭遇しました．非常に見づらいです．pgfをupdateする前はそんなことはなかったので，おそらくbeamer側が新しいpgfに対応できてないのかなどと考えネットを探ると同じ問題が取り上げられており，パッチまでありました．
http://sourceforge.net/p/latex-beamer/bugs/280/
このページのbeamerbaseauxtemplates.sty.diffを取ってきてその通りに修正すると，元通りenumerateでballの中の数字の色が白に戻りました．
本家にはまだ取り入れられてないようです．
とりあえずご報告まで．