ありがとうございます！ Buildして、standaloneパッケージを使ってみました。
\usepackage[mode=buildnew]{standalone} や \includestandalone[mode=buildnew]{file名} の
オプション mode=buildnew が正しく機能しています。素晴らしい！
なお XeLaTeX で mode=buildnew を用いると、warining と共に mode=build へと変更されます。これで XeTeX エンジンでは出来ないことが pTeX では出来るようになりました。