framebox を includegraphics に置き換えて実行することで目的が達成しました。
ありがとうございました。
\documentclass{jarticle}
\usepackage[dvipdfmx,hiresbb]{graphicx}
\begin{document}
\begin{figure}[htbp]
\centering
\begin{tabular}{cc}
\includegraphics[width=6cm]{./pdf3/grf-a.pdf}&\includegraphics[width=6cm]{./pdf3/grf-b.pdf}\\[3mm]
\includegraphics[width=6cm]{./pdf3/grf-c.pdf}&\includegraphics[width=6cm]{./pdf3/grf-d.pdf}\\[3mm]
\includegraphics[width=6cm]{./pdf3/grf-e.pdf}&
\end{tabular}
\caption{tabular}
\end{figure}
\end{document}