丁寧なご説明をありがとうございます。
cid-x.mapのotf-cjmr-hの対応フォント指定をKozMinProVI-Regularに変更するという方法で無事出力できました。
今※以下の理由を考えてみてはいるのですが根本的に埋込と非埋込の違いがよくわかっていません。
KozMinProVI-Regularが持つ固有の字幅がTeXの指定と一致しない？とか安直なことを考えてみたりしていますが…
少なくとも自分はTeXシステム内にフォントは置いていません(初期から変更なし)しAdobeのフォルダをみてもKozMinPr6N-Regular.otfしか持っていないようです。
もう少し書籍を読んだりして考えてみます。
返信が遅くなり申し訳ありませんでした。