> パソコンから，beamer 3.07 をコピーし，
> beamerbasecompatibility.sty
> のパッチをあてたところ，
それも正解ですね．
よくよく確認してみたところ，http://bitbucket.org/rivanvx/beamer/ からダウンロードせずに，CTAN http://www.ctan.org/tex-archive/macros/latex/contrib/beamer/ からダウンロードしたものならうまくいくようです．
# 3.08 は CTAN からダウンロードしてうまくいっていたのに，3.09 を bitbucket からダウンロードして，原因がよくわからず数時間格闘してしまいました……．
3.10 は TeX Live 2010 収録版になるように，ということなので，もうしばらくして確定したところのほうが安定するかもしれません．