LaTeXiTはアウトライン化したeps/pdfを出力できませんでしたか？
＃そういう設定ができたと思いますが．．．
＃KlatexFormulaに乗り換えて時間が経ったので，勘違いしているかもしれません
munepiさんへのコメントと関係しますが，Inkscapeとその拡張機能のTexTextを使えば，
Inkscape上でアウトライン化した数式を作成できます（LaTeXiTもKlatexFormulaも不要）．
＃TexTextは作成した数式をアウトライン化しますが，（オブジェクトのグループ解除を
＃しなければ）再編集可能です