babelマニュアルをmendexでコンパイルする方法ですが、次のように処理すると，
エラーを回避できるようです。

latex babel.drvで生成されるbabel.idxの次の個所を訂正します。

  \indexentry{turkish@sh@=@=\verb!*+\turkish@sh@=@+|main}{45.43}
                         ^                      ^
2箇所の=を!=!のように引用符で括り、mendex -s bbind.ist babelの処理を
行います。

確かに、mendexでbabel.idxをそのまま処理すると Extra `=' at position... と
エラーが出て失敗しますが、実は、makeindxでもエラーとなっていると思います。
処理がストップしないだけです。babel.ilgをご確認下さい。

上記のエラーメッセージは、LaTeXコンパニオンに説明がありますが、=に引用符を
付けなければならない、という意味のようです。mendex (makeindx)で読みこむ
bbind.istの定義は次のようになっています。
  actual '='
  quote '!'

なお、エラーでストップすることはありませんが、印字されない! にも!!!のように
引用符を付けておく必要がありそうです。次の箇所です。
  \indexentry{turkish@sh@!@=\verb!*+\turkish@sh@!@+|main}{45.43}
  russian@sh@!@およびsystem@sh@!@の項目

もう一点，glossaryの個所も修正する必要があるかもしれません。
babel.dtx
  132 \texttt{\}
frenchb.dtx
 1215 MI\TeX.
 1222 MI\TeX.
 1223 \LaTeXe.
 1224 MI\TeX.
babel.gls
 1304 \^^fd| |^^ff|

稲垣　徹